科學家發(fā)現(xiàn)演化新模式:通過附著在基因表面的分子
時間:2025-11-26 06:45:40 來源:桑間濮上網(wǎng) 作者:焦點 閱讀:586次

科學家發(fā)現(xiàn)了一種不依賴于DNA的自然選擇方式
(神秘的地球uux.cn報道)據(jù)新浪科技(任天):演化和自然選擇發(fā)生在脫氧核糖核酸(DNA)水平上,因為基因突變和遺傳特征要么保留下來,家發(fā)基因要么隨時間而消失。現(xiàn)演上海美女包養(yǎng)(電話微信199-7144-9724)提供頂級外圍女上門,可滿足你的一切要求但是化新現(xiàn)在,科學家們認為演化也可能發(fā)生在一個完全不同的模式尺度上,不是通過通過基因,而是表面通過附著在基因表面的分子。
這些分子被稱為甲基(methyl group),科學它們會改變DNA的家發(fā)基因結(jié)構,并能開啟和關閉基因。現(xiàn)演這種改變被稱為“表觀遺傳修飾”,化新意味著它們出現(xiàn)在基因組的模式“上面”。包括人類在內(nèi)的通過許多生物的DNA中都點綴著甲基,但像果蠅和蛔蟲這樣的表面生物在演化過程中卻丟失了實現(xiàn)這一過程的基因。
另一種生物,科學上海美女包養(yǎng)(電話微信199-7144-9724)提供頂級外圍女上門,可滿足你的一切要求新型隱球菌(Cryptococcus neoformans),一種普遍存在的酵母菌,在大約5000萬到1.5億年前的白堊紀時期也丟失了甲基化的關鍵基因。但值得注意的是,以目前的形態(tài),這種真菌的基因組上仍然具有甲基。根據(jù)1月16日發(fā)表在《細胞》(Cell)雜志上的一項研究,現(xiàn)在科學家提出了一個理論,認為新發(fā)現(xiàn)的一種演化模式使新型隱球菌能夠在數(shù)千萬年的時間里一直保留著表觀遺傳編輯記錄。
美國加州大學舊金山分校生物化學和生物物理學教授、陳-扎克伯格生物中心(Chan Zuckerberg Biohub)首席研究員Hiten Madhani博士表示,這項研究背后的科學家并沒有預計能發(fā)現(xiàn)這樣一個保守得很好的演化秘密。
該研究小組之所以研究新型隱球菌,主要是為了更好地了解這種酵母菌如何導致人類患上真菌性腦膜炎。據(jù)加州大學舊金山分校的一份聲明稱,這種真菌往往會感染免疫系統(tǒng)脆弱的人,導致大約20%的艾滋病相關死亡。Madhani和同事們花了大量的時間來挖掘新型隱球菌的遺傳密碼,尋找?guī)椭摻湍溉肭秩祟惣毎年P鍵基因。然而,當有報道稱,這種真菌的基因物質(zhì)可被甲基修飾時,研究小組感到十分驚訝。
Madhani說:“當我們知道新型隱球菌具有DNA甲基化時……我覺得,我們必須了解一下,我們完全不知道會發(fā)現(xiàn)什么。”
在脊椎動物和植物中,細胞可以在兩種酶的幫助下向DNA中添加甲基。第一種酶是“DNA從頭甲基化酶”(de novo methyltransferase),能將甲基附著在未修飾的基因上。這種酶在每一條螺旋狀DNA鏈上都加入了相同模式的甲基,形成了對稱的設計。在細胞分裂過程中,雙螺旋展開,并由匹配的雙鏈構建出兩條新的DNA鏈。這時,“DNA甲基化維持酶”(maintenance methyltransferase)會突然出現(xiàn),把所有的甲基從原來的DNA鏈上復制到新形成的DNA鏈上。
Madhani和同事們通過觀察現(xiàn)有的演化樹來追溯新型隱球菌的歷史,發(fā)現(xiàn)在白堊紀時期,這種酵母的祖先同時擁有DNA甲基化所需的兩種酶。但是,在演化歷史的某個位置,新型隱球菌失去了制造DNA從頭甲基化酶所需的基因。沒有這種酶,有機體就再也不能向DNA添加新的甲基了,而是只能用DNA甲基化維持酶來復制現(xiàn)有的甲基。
從理論上講,即使是單獨工作,這種維持酶也可以使DNA的甲基化無限期地存在——如果每次都能產(chǎn)生一個完美拷貝的話。
研究小組發(fā)現(xiàn),實際上,這種酶在每次細胞分裂時都會出錯,并失去甲基的蹤跡。在有蓋培養(yǎng)皿中培養(yǎng)時,新型隱球菌細胞偶爾會隨機獲得新的甲基,這與DNA中的隨機突變類似。然而,細胞失去甲基的速度比獲得新甲基的速度快了20倍。
研究小組估計,在大約7500代的時間里,全部甲基都會消失,使得維持酶無法再進行復制。考慮到新型隱球菌繁殖的速度,這種酵母在大約130年內(nèi)就會失去所有的甲基。然而,現(xiàn)實恰恰相反,新型隱球菌保留了數(shù)千萬年的表觀遺傳編輯。
Madhani說:“由于甲基化的損失率高于獲得率,因此如果沒有一種機制來維持甲基化,那么隨著時間的推移,這個甲基化系統(tǒng)將慢慢消失。”他指出,這種機制其實就是自然選擇。換句話說,盡管新型隱球菌獲得新甲基的速度比失去的速度慢得多,但甲基化極大提高了有機體的“適應性”,這意味著它們可以在競爭中勝過甲基化程度較低的個體。“適應”的個體比甲基少的個體更占優(yōu)勢,因此,新型隱球菌的甲基化水平在數(shù)百萬年里一直保持較高水平。但是,這些甲基能給新物種帶來什么樣的演化優(yōu)勢呢?Madhani表示,甲基可能會保護酵母的基因組免受潛在的致命傷害。
轉(zhuǎn)座子,也被稱為“跳躍基因”,是一類可以隨心所欲地在基因組中跳來跳去的DNA序列。它們還經(jīng)常把自己插入非常“不方便”的位置。例如,轉(zhuǎn)座子可以跳躍到細胞生存所必需的基因中間,導致那個細胞失能或死亡。幸運的是,甲基可以抓住轉(zhuǎn)座子并將其固定。Madhani表示,新型隱球菌之所以維持了一定水平的DNA甲基化,可能就是為了控制轉(zhuǎn)座子。
“沒有哪一個單獨的[甲基化]位點特別重要,但在演化的時間尺度上,整體的甲基化密度對轉(zhuǎn)座子進行了選擇,”Madhani補充道,“在我們的基因組中,情況可能也是如此。”
新型隱球菌的DNA甲基化仍然縈繞在許多未解之謎。根據(jù)Madhani 在2008年發(fā)表的一項研究,DNA甲基化維持酶除了在DNA鏈之間復制甲基外,還可能影響著新型隱球菌對人類的感染情況。沒有完整的維持酶,這種真菌就不能有效地侵入人體細胞。Madhani說:“我們不知道為什么需要這種酶才能有效地感染。”
DNA甲基化維持酶還需要大量的化學能才能發(fā)揮作用,并且只能將甲基復制到已復制DNA鏈的空白部分。相比之下,根據(jù)預印本網(wǎng)站bioRxiv上發(fā)布的一份報告,其他生物體內(nèi)的這種酶不需要額外的能量就能發(fā)揮作用,有時還會與沒有任何甲基的DNA相互作用。進一步的研究將揭示甲基化是如何在新型隱球菌細胞發(fā)揮作用,以及這種新發(fā)現(xiàn)的演化形式是否會出現(xiàn)在其他生物體中。
(責任編輯:綜合)
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